انجمن‌های علمی پژوهشی تشکلی با ماهیت پژوهشی است که از سال 1394، با هدف تقویت و ترویج فرهنگ پژوهش، ارتقای روحیه و بنیه‌‌ی علمی طلاب مستعد، فراهم آوردن زمینه‌های مناسب برای فعالیت‌های جمعی علمی پژوهشی و بهره‌گیری از توانمندی و خلاقیت آنان در تحقق توسعه علمی و نهضت تولید علم تشکیل و راه‌اندازی شد. این انجمن‌ها در 10 گروه علمی پژوهشی «تفسیر و علوم قرآن»، «تعلیم و تربیت»، «تاریخ»، «فقه و اصول»، «تبلیغ با گرایش حج»، «فلسفه»، «کلام»، «زن و خانواده»، «مهدویت» و «ادبیات عرب» به فعالیت می­ پردازند.