معاونت پژوهش با هدف جذب و پرورش استعدادهای پژوهشی و طلاب علاقمند به امر پژوهش، آموزش مهارت‌های به‌کارگیری و پردازش اطلاعات به صورت کاربردی و تعلیم دانش‌های ضروری برای اجرای یک فرایند پژوهشی، از سال 1394 اقدام به برگزاری دوره تربیت محقق نمود‌ه است. این دوره‌ها طی یک دوره هجده ماهه (سه نیمسال تحصیلی) و حداقل 16 جلسه علمی دو ساعته در هر نیمسال، به همراه تأمین نیازهای پژوهشی اعم از نشست‌ها و کارگاه‌های مهارتی و روشی برگزار می‌شود.

تا کنون سه دوره حضوری و یک دوره مجازی برگزار شده است و در حال حاضر، چهارمین دوره حضوری در رشته‌های فقه و اصول، تعلیم و تربیت و فلسفه و کلام اسلامی در حال برگزاری است.